Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AMY2BP19961 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMY2BP19961 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMY2BP19961 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMY2BP19961 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMY2BP19961 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMY2BP19961 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMY2BP19961 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMY2BP19961 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms