Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ATF3P18847 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ATF3P18847 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
ATF3P18847 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ATF3P18847 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
ATF3P18847 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ATF3P18847 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ATF3P18847 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ATF3P18847 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ATF3P18847 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ATF3P18847 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ATF3P18847 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ATF3P18847 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
ATF3P18847 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ATF3P18847 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ATF3P18847 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ATF3P18847 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATF3P18847 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ATF3P18847 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ATF3P18847 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ATF3P18847 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ATF3P18847 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ATF3P18847 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ATF3P18847 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ATF3P18847 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ATF3P18847 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ATF3P18847 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ATF3P18847 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
ATF3P18847 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATF3P18847 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATF3P18847 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ATF3P18847 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
ATF3P18847 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATF3P18847 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATF3P18847 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
ATF3P18847 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATF3P18847 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATF3P18847 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATF3P18847 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATF3P18847 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ATF3P18847 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATF3P18847 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF3P18847 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF3P18847 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF3P18847 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF3P18847 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF3P18847 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF3P18847 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF3P18847 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF3P18847 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATF3P18847 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ATF3P18847 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ATF3P18847 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATF3P18847 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATF3P18847 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATF3P18847 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATF3P18847 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATF3P18847 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATF3P18847 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATF3P18847 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ATF3P18847 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
ATF3P18847 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ATF3P18847 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATF3P18847 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATF3P18847 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATF3P18847 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATF3P18847 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATF3P18847 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ATF3P18847 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATF3P18847 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ATF3P18847 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATF3P18847 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATF3P18847 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATF3P18847 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ATF3P18847 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ATF3P18847 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
ATF3P18847 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
ATF3P18847 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
ATF3P18847 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ATF3P18847 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATF3P18847 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATF3P18847 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATF3P18847 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ATF3P18847 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATF3P18847 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ATF3P18847 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ATF3P18847 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ATF3P18847 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ATF3P18847 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATF3P18847 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATF3P18847 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ATF3P18847 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATF3P18847 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATF3P18847 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
ATF3P18847 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ATF3P18847 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATF3P18847 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ATF3P18847 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ATF3P18847 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ATF3P18847 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms