Protein–RNA interactions for Protein: P17927

CR1, Complement receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1P17927 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CR1P17927 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CR1P17927 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CR1P17927 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CR1P17927 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CR1P17927 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CR1P17927 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CR1P17927 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CR1P17927 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CR1P17927 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CR1P17927 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CR1P17927 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CR1P17927 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CR1P17927 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CR1P17927 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CR1P17927 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CR1P17927 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CR1P17927 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CR1P17927 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CR1P17927 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CR1P17927 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CR1P17927 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CR1P17927 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CR1P17927 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CR1P17927 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CR1P17927 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CR1P17927 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CR1P17927 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CR1P17927 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CR1P17927 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CR1P17927 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CR1P17927 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CR1P17927 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CR1P17927 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CR1P17927 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CR1P17927 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CR1P17927 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CR1P17927 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CR1P17927 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CR1P17927 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CR1P17927 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CR1P17927 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CR1P17927 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CR1P17927 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CR1P17927 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CR1P17927 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CR1P17927 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CR1P17927 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CR1P17927 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CR1P17927 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CR1P17927 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CR1P17927 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CR1P17927 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CR1P17927 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CR1P17927 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CR1P17927 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CR1P17927 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CR1P17927 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CR1P17927 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CR1P17927 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CR1P17927 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CR1P17927 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CR1P17927 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CR1P17927 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CR1P17927 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1P17927 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1P17927 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CR1P17927 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CR1P17927 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CR1P17927 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1P17927 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1P17927 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1P17927 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CR1P17927 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CR1P17927 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CR1P17927 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CR1P17927 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CR1P17927 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CR1P17927 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CR1P17927 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CR1P17927 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CR1P17927 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CR1P17927 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CR1P17927 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CR1P17927 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CR1P17927 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CR1P17927 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CR1P17927 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1P17927 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1P17927 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1P17927 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1P17927 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CR1P17927 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1P17927 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1P17927 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1P17927 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1P17927 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CR1P17927 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CR1P17927 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CR1P17927 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms