Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSHRP16473 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSHRP16473 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSHRP16473 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSHRP16473 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHRP16473 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHRP16473 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSHRP16473 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHRP16473 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSHRP16473 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSHRP16473 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSHRP16473 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHRP16473 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSHRP16473 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSHRP16473 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHRP16473 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSHRP16473 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSHRP16473 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHRP16473 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSHRP16473 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHRP16473 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHRP16473 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSHRP16473 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHRP16473 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSHRP16473 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHRP16473 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHRP16473 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHRP16473 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHRP16473 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSHRP16473 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSHRP16473 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSHRP16473 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSHRP16473 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSHRP16473 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TSHRP16473 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHRP16473 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHRP16473 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSHRP16473 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TSHRP16473 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHRP16473 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHRP16473 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSHRP16473 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHRP16473 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHRP16473 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHRP16473 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHRP16473 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSHRP16473 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSHRP16473 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSHRP16473 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSHRP16473 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSHRP16473 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSHRP16473 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSHRP16473 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSHRP16473 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSHRP16473 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSHRP16473 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSHRP16473 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSHRP16473 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSHRP16473 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSHRP16473 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSHRP16473 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSHRP16473 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSHRP16473 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TSHRP16473 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSHRP16473 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSHRP16473 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSHRP16473 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSHRP16473 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TSHRP16473 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSHRP16473 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TSHRP16473 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSHRP16473 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSHRP16473 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSHRP16473 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSHRP16473 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSHRP16473 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSHRP16473 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSHRP16473 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TSHRP16473 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSHRP16473 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSHRP16473 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSHRP16473 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSHRP16473 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSHRP16473 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSHRP16473 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSHRP16473 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSHRP16473 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSHRP16473 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSHRP16473 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSHRP16473 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSHRP16473 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSHRP16473 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSHRP16473 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSHRP16473 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSHRP16473 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSHRP16473 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHRP16473 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHRP16473 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHRP16473 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSHRP16473 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms