Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRF1P14222 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRF1P14222 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRF1P14222 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRF1P14222 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRF1P14222 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRF1P14222 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRF1P14222 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRF1P14222 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRF1P14222 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRF1P14222 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRF1P14222 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRF1P14222 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRF1P14222 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRF1P14222 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRF1P14222 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRF1P14222 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRF1P14222 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRF1P14222 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRF1P14222 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRF1P14222 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRF1P14222 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRF1P14222 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRF1P14222 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRF1P14222 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRF1P14222 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRF1P14222 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRF1P14222 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRF1P14222 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRF1P14222 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRF1P14222 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRF1P14222 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRF1P14222 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRF1P14222 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRF1P14222 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRF1P14222 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRF1P14222 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRF1P14222 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRF1P14222 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRF1P14222 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRF1P14222 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRF1P14222 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRF1P14222 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRF1P14222 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRF1P14222 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRF1P14222 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRF1P14222 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRF1P14222 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRF1P14222 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRF1P14222 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRF1P14222 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRF1P14222 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRF1P14222 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRF1P14222 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRF1P14222 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRF1P14222 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRF1P14222 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRF1P14222 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRF1P14222 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRF1P14222 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRF1P14222 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRF1P14222 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRF1P14222 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRF1P14222 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRF1P14222 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRF1P14222 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRF1P14222 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRF1P14222 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRF1P14222 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRF1P14222 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRF1P14222 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRF1P14222 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRF1P14222 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRF1P14222 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRF1P14222 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRF1P14222 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRF1P14222 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRF1P14222 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRF1P14222 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRF1P14222 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRF1P14222 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRF1P14222 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRF1P14222 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRF1P14222 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRF1P14222 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRF1P14222 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRF1P14222 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRF1P14222 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRF1P14222 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRF1P14222 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRF1P14222 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRF1P14222 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRF1P14222 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRF1P14222 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRF1P14222 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRF1P14222 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRF1P14222 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRF1P14222 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRF1P14222 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRF1P14222 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms