Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2F2P13984 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2F2P13984 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2F2P13984 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2F2P13984 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2F2P13984 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2F2P13984 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2F2P13984 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2F2P13984 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2F2P13984 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms