Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMP2P13473 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMP2P13473 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMP2P13473 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LAMP2P13473 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LAMP2P13473 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LAMP2P13473 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMP2P13473 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMP2P13473 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMP2P13473 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMP2P13473 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMP2P13473 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms