Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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