Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPCP11686 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFTPCP11686 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPCP11686 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPCP11686 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFTPCP11686 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFTPCP11686 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPCP11686 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPCP11686 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPCP11686 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms