Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EPB41P11171 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EPB41P11171 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EPB41P11171 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EPB41P11171 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPB41P11171 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPB41P11171 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EPB41P11171 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EPB41P11171 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EPB41P11171 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EPB41P11171 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPB41P11171 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPB41P11171 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPB41P11171 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPB41P11171 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPB41P11171 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EPB41P11171 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EPB41P11171 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPB41P11171 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPB41P11171 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPB41P11171 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EPB41P11171 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41P11171 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41P11171 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41P11171 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPB41P11171 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPB41P11171 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EPB41P11171 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41P11171 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPB41P11171 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPB41P11171 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41P11171 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPB41P11171 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPB41P11171 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EPB41P11171 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EPB41P11171 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPB41P11171 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EPB41P11171 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41P11171 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41P11171 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41P11171 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPB41P11171 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EPB41P11171 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EPB41P11171 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EPB41P11171 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EPB41P11171 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EPB41P11171 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EPB41P11171 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EPB41P11171 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPB41P11171 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPB41P11171 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPB41P11171 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41P11171 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPB41P11171 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EPB41P11171 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EPB41P11171 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EPB41P11171 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPB41P11171 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPB41P11171 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPB41P11171 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPB41P11171 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPB41P11171 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPB41P11171 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPB41P11171 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPB41P11171 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPB41P11171 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41P11171 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41P11171 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPB41P11171 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41P11171 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41P11171 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EPB41P11171 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41P11171 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41P11171 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EPB41P11171 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41P11171 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EPB41P11171 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPB41P11171 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EPB41P11171 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41P11171 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41P11171 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EPB41P11171 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41P11171 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41P11171 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41P11171 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41P11171 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EPB41P11171 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41P11171 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41P11171 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPB41P11171 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41P11171 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPB41P11171 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41P11171 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41P11171 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41P11171 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EPB41P11171 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41P11171 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EPB41P11171 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EPB41P11171 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPB41P11171 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms