Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLUP10909 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLUP10909 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLUP10909 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLUP10909 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLUP10909 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLUP10909 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLUP10909 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLUP10909 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUP10909 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLUP10909 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUP10909 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLUP10909 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUP10909 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUP10909 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLUP10909 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLUP10909 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUP10909 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLUP10909 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUP10909 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUP10909 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLUP10909 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLUP10909 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLUP10909 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUP10909 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUP10909 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLUP10909 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLUP10909 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLUP10909 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLUP10909 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLUP10909 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLUP10909 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLUP10909 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLUP10909 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLUP10909 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLUP10909 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUP10909 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUP10909 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLUP10909 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUP10909 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLUP10909 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLUP10909 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUP10909 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUP10909 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLUP10909 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUP10909 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLUP10909 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUP10909 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLUP10909 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLUP10909 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLUP10909 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLUP10909 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLUP10909 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLUP10909 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLUP10909 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLUP10909 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLUP10909 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLUP10909 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLUP10909 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLUP10909 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLUP10909 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLUP10909 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLUP10909 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLUP10909 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLUP10909 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLUP10909 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLUP10909 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLUP10909 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLUP10909 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLUP10909 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLUP10909 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLUP10909 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLUP10909 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLUP10909 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLUP10909 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLUP10909 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLUP10909 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLUP10909 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLUP10909 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLUP10909 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLUP10909 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLUP10909 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLUP10909 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLUP10909 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLUP10909 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLUP10909 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLUP10909 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLUP10909 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLUP10909 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLUP10909 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLUP10909 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLUP10909 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLUP10909 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLUP10909 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLUP10909 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLUP10909 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLUP10909 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLUP10909 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLUP10909 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLUP10909 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms