Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HKR1P10072 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HKR1P10072 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HKR1P10072 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HKR1P10072 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HKR1P10072 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HKR1P10072 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HKR1P10072 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HKR1P10072 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HKR1P10072 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HKR1P10072 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HKR1P10072 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HKR1P10072 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HKR1P10072 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HKR1P10072 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HKR1P10072 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HKR1P10072 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HKR1P10072 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HKR1P10072 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HKR1P10072 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HKR1P10072 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HKR1P10072 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HKR1P10072 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HKR1P10072 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HKR1P10072 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HKR1P10072 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HKR1P10072 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HKR1P10072 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HKR1P10072 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HKR1P10072 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HKR1P10072 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HKR1P10072 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HKR1P10072 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HKR1P10072 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HKR1P10072 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HKR1P10072 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HKR1P10072 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HKR1P10072 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HKR1P10072 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HKR1P10072 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HKR1P10072 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HKR1P10072 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HKR1P10072 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HKR1P10072 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HKR1P10072 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HKR1P10072 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HKR1P10072 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HKR1P10072 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HKR1P10072 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HKR1P10072 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HKR1P10072 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HKR1P10072 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HKR1P10072 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HKR1P10072 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKR1P10072 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKR1P10072 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HKR1P10072 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKR1P10072 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HKR1P10072 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKR1P10072 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKR1P10072 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HKR1P10072 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HKR1P10072 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKR1P10072 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HKR1P10072 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HKR1P10072 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKR1P10072 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HKR1P10072 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HKR1P10072 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HKR1P10072 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HKR1P10072 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKR1P10072 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKR1P10072 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HKR1P10072 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKR1P10072 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HKR1P10072 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HKR1P10072 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKR1P10072 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HKR1P10072 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HKR1P10072 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKR1P10072 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HKR1P10072 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKR1P10072 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKR1P10072 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HKR1P10072 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HKR1P10072 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HKR1P10072 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HKR1P10072 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKR1P10072 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HKR1P10072 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HKR1P10072 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HKR1P10072 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HKR1P10072 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms