Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
C4BP0C0L5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
C4BP0C0L5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
C4BP0C0L5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
C4BP0C0L5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.23
C4BP0C0L5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
C4BP0C0L5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
C4BP0C0L5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
C4BP0C0L5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
C4BP0C0L5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
C4BP0C0L5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
C4BP0C0L5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
C4BP0C0L5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
C4BP0C0L5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
C4BP0C0L5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
C4BP0C0L5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
C4BP0C0L5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
C4BP0C0L5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
C4BP0C0L5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
C4BP0C0L5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
C4BP0C0L5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
C4BP0C0L5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
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