Protein–RNA interactions for Protein: P09001

MRPL3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL3P09001 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL3P09001 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL3P09001 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL3P09001 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL3P09001 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL3P09001 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL3P09001 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL3P09001 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL3P09001 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL3P09001 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL3P09001 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL3P09001 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL3P09001 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL3P09001 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL3P09001 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL3P09001 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL3P09001 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms