Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGFRP08138 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGFRP08138 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NGFRP08138 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGFRP08138 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGFRP08138 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NGFRP08138 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGFRP08138 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGFRP08138 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGFRP08138 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGFRP08138 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGFRP08138 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGFRP08138 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGFRP08138 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGFRP08138 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGFRP08138 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGFRP08138 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NGFRP08138 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NGFRP08138 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGFRP08138 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGFRP08138 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NGFRP08138 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGFRP08138 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGFRP08138 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGFRP08138 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NGFRP08138 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NGFRP08138 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGFRP08138 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGFRP08138 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGFRP08138 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGFRP08138 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGFRP08138 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGFRP08138 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NGFRP08138 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGFRP08138 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NGFRP08138 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NGFRP08138 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NGFRP08138 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NGFRP08138 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NGFRP08138 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NGFRP08138 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NGFRP08138 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NGFRP08138 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NGFRP08138 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NGFRP08138 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NGFRP08138 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NGFRP08138 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NGFRP08138 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NGFRP08138 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGFRP08138 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGFRP08138 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NGFRP08138 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NGFRP08138 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGFRP08138 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGFRP08138 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGFRP08138 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NGFRP08138 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NGFRP08138 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGFRP08138 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGFRP08138 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGFRP08138 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NGFRP08138 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGFRP08138 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NGFRP08138 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGFRP08138 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGFRP08138 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NGFRP08138 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NGFRP08138 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NGFRP08138 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NGFRP08138 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NGFRP08138 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NGFRP08138 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NGFRP08138 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NGFRP08138 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NGFRP08138 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGFRP08138 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGFRP08138 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGFRP08138 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGFRP08138 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGFRP08138 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGFRP08138 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGFRP08138 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGFRP08138 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGFRP08138 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGFRP08138 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGFRP08138 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGFRP08138 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGFRP08138 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGFRP08138 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGFRP08138 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGFRP08138 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NGFRP08138 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGFRP08138 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGFRP08138 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NGFRP08138 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NGFRP08138 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NGFRP08138 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGFRP08138 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NGFRP08138 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NGFRP08138 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms