Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPLP06858 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPLP06858 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPLP06858 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LPLP06858 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LPLP06858 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LPLP06858 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPLP06858 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPLP06858 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPLP06858 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPLP06858 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPLP06858 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPLP06858 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LPLP06858 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPLP06858 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPLP06858 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPLP06858 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPLP06858 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPLP06858 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPLP06858 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPLP06858 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPLP06858 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPLP06858 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPLP06858 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPLP06858 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPLP06858 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPLP06858 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LPLP06858 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPLP06858 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPLP06858 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPLP06858 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LPLP06858 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPLP06858 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPLP06858 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LPLP06858 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPLP06858 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPLP06858 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LPLP06858 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPLP06858 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LPLP06858 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPLP06858 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPLP06858 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LPLP06858 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPLP06858 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPLP06858 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPLP06858 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPLP06858 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPLP06858 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPLP06858 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPLP06858 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPLP06858 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPLP06858 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPLP06858 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPLP06858 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPLP06858 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPLP06858 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPLP06858 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPLP06858 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPLP06858 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPLP06858 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPLP06858 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPLP06858 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPLP06858 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPLP06858 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPLP06858 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPLP06858 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPLP06858 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LPLP06858 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPLP06858 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPLP06858 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPLP06858 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LPLP06858 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LPLP06858 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPLP06858 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LPLP06858 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPLP06858 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LPLP06858 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPLP06858 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPLP06858 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LPLP06858 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LPLP06858 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPLP06858 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPLP06858 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPLP06858 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LPLP06858 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LPLP06858 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LPLP06858 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPLP06858 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPLP06858 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPLP06858 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPLP06858 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LPLP06858 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPLP06858 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LPLP06858 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPLP06858 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPLP06858 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPLP06858 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPLP06858 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPLP06858 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LPLP06858 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms