Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFNW1P05000 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNW1P05000 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNW1P05000 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFNW1P05000 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNW1P05000 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFNW1P05000 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNW1P05000 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNW1P05000 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms