Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GYPCP04921 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GYPCP04921 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GYPCP04921 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GYPCP04921 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GYPCP04921 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GYPCP04921 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GYPCP04921 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GYPCP04921 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GYPCP04921 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GYPCP04921 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GYPCP04921 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYPCP04921 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYPCP04921 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYPCP04921 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYPCP04921 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GYPCP04921 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GYPCP04921 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GYPCP04921 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GYPCP04921 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GYPCP04921 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GYPCP04921 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GYPCP04921 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GYPCP04921 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GYPCP04921 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GYPCP04921 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GYPCP04921 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GYPCP04921 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GYPCP04921 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GYPCP04921 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GYPCP04921 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GYPCP04921 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GYPCP04921 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GYPCP04921 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GYPCP04921 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GYPCP04921 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GYPCP04921 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GYPCP04921 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GYPCP04921 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GYPCP04921 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GYPCP04921 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GYPCP04921 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GYPCP04921 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GYPCP04921 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GYPCP04921 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GYPCP04921 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GYPCP04921 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GYPCP04921 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GYPCP04921 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GYPCP04921 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GYPCP04921 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GYPCP04921 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GYPCP04921 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GYPCP04921 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GYPCP04921 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GYPCP04921 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GYPCP04921 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GYPCP04921 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GYPCP04921 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GYPCP04921 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYPCP04921 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYPCP04921 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYPCP04921 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GYPCP04921 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GYPCP04921 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GYPCP04921 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GYPCP04921 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GYPCP04921 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GYPCP04921 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GYPCP04921 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GYPCP04921 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GYPCP04921 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GYPCP04921 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GYPCP04921 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GYPCP04921 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GYPCP04921 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GYPCP04921 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GYPCP04921 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GYPCP04921 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GYPCP04921 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GYPCP04921 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GYPCP04921 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GYPCP04921 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GYPCP04921 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GYPCP04921 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GYPCP04921 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GYPCP04921 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GYPCP04921 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GYPCP04921 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GYPCP04921 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GYPCP04921 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GYPCP04921 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GYPCP04921 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GYPCP04921 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GYPCP04921 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GYPCP04921 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GYPCP04921 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GYPCP04921 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GYPCP04921 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GYPCP04921 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms