Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFF1P04155 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFF1P04155 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFF1P04155 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFF1P04155 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF1P04155 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFF1P04155 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFF1P04155 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFF1P04155 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFF1P04155 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFF1P04155 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFF1P04155 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFF1P04155 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFF1P04155 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFF1P04155 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFF1P04155 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFF1P04155 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFF1P04155 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFF1P04155 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFF1P04155 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFF1P04155 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF1P04155 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF1P04155 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF1P04155 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFF1P04155 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF1P04155 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF1P04155 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF1P04155 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF1P04155 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF1P04155 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFF1P04155 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFF1P04155 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFF1P04155 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFF1P04155 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFF1P04155 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFF1P04155 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFF1P04155 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFF1P04155 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFF1P04155 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF1P04155 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF1P04155 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFF1P04155 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF1P04155 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFF1P04155 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFF1P04155 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF1P04155 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF1P04155 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFF1P04155 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFF1P04155 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFF1P04155 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFF1P04155 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFF1P04155 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFF1P04155 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFF1P04155 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF1P04155 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF1P04155 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFF1P04155 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFF1P04155 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF1P04155 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFF1P04155 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFF1P04155 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFF1P04155 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFF1P04155 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFF1P04155 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFF1P04155 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFF1P04155 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFF1P04155 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFF1P04155 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF1P04155 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF1P04155 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF1P04155 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF1P04155 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFF1P04155 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFF1P04155 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFF1P04155 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF1P04155 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFF1P04155 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF1P04155 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF1P04155 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFF1P04155 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFF1P04155 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFF1P04155 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFF1P04155 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFF1P04155 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFF1P04155 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFF1P04155 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TFF1P04155 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFF1P04155 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TFF1P04155 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFF1P04155 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TFF1P04155 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TFF1P04155 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TFF1P04155 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TFF1P04155 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms