Protein–RNA interactions for Protein: P01597

IGKV1-39, Immunoglobulin kappa variable 1-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-39P01597 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1-39P01597 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1-39P01597 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1-39P01597 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IGKV1-39P01597 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1-39P01597 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV1-39P01597 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1-39P01597 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV1-39P01597 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms