Protein–RNA interactions for Protein: P00709

LALBA, Alpha-lactalbumin, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LALBAP00709 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LALBAP00709 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LALBAP00709 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LALBAP00709 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LALBAP00709 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LALBAP00709 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LALBAP00709 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LALBAP00709 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LALBAP00709 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LALBAP00709 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LALBAP00709 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LALBAP00709 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LALBAP00709 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LALBAP00709 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LALBAP00709 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LALBAP00709 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LALBAP00709 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LALBAP00709 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LALBAP00709 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LALBAP00709 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LALBAP00709 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LALBAP00709 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LALBAP00709 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LALBAP00709 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LALBAP00709 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LALBAP00709 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LALBAP00709 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LALBAP00709 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LALBAP00709 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LALBAP00709 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LALBAP00709 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LALBAP00709 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LALBAP00709 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LALBAP00709 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LALBAP00709 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LALBAP00709 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LALBAP00709 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LALBAP00709 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LALBAP00709 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LALBAP00709 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LALBAP00709 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LALBAP00709 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LALBAP00709 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LALBAP00709 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LALBAP00709 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LALBAP00709 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LALBAP00709 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LALBAP00709 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LALBAP00709 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LALBAP00709 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LALBAP00709 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LALBAP00709 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LALBAP00709 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LALBAP00709 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LALBAP00709 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LALBAP00709 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LALBAP00709 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LALBAP00709 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LALBAP00709 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LALBAP00709 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LALBAP00709 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LALBAP00709 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LALBAP00709 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LALBAP00709 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LALBAP00709 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LALBAP00709 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LALBAP00709 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LALBAP00709 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LALBAP00709 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LALBAP00709 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LALBAP00709 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LALBAP00709 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LALBAP00709 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LALBAP00709 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LALBAP00709 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LALBAP00709 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LALBAP00709 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LALBAP00709 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LALBAP00709 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LALBAP00709 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LALBAP00709 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LALBAP00709 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LALBAP00709 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LALBAP00709 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LALBAP00709 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LALBAP00709 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LALBAP00709 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LALBAP00709 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LALBAP00709 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LALBAP00709 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LALBAP00709 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LALBAP00709 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LALBAP00709 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LALBAP00709 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms