Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MATN4O95460 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MATN4O95460 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MATN4O95460 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MATN4O95460 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MATN4O95460 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MATN4O95460 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MATN4O95460 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MATN4O95460 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MATN4O95460 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MATN4O95460 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MATN4O95460 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MATN4O95460 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MATN4O95460 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MATN4O95460 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MATN4O95460 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MATN4O95460 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MATN4O95460 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MATN4O95460 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MATN4O95460 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MATN4O95460 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MATN4O95460 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MATN4O95460 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MATN4O95460 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MATN4O95460 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MATN4O95460 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MATN4O95460 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MATN4O95460 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MATN4O95460 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MATN4O95460 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MATN4O95460 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MATN4O95460 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MATN4O95460 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MATN4O95460 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MATN4O95460 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MATN4O95460 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MATN4O95460 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MATN4O95460 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MATN4O95460 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MATN4O95460 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MATN4O95460 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MATN4O95460 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MATN4O95460 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MATN4O95460 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MATN4O95460 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MATN4O95460 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MATN4O95460 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MATN4O95460 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MATN4O95460 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MATN4O95460 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MATN4O95460 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MATN4O95460 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MATN4O95460 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MATN4O95460 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MATN4O95460 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MATN4O95460 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MATN4O95460 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MATN4O95460 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MATN4O95460 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MATN4O95460 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MATN4O95460 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MATN4O95460 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MATN4O95460 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MATN4O95460 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MATN4O95460 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MATN4O95460 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MATN4O95460 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MATN4O95460 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MATN4O95460 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MATN4O95460 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MATN4O95460 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MATN4O95460 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MATN4O95460 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MATN4O95460 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MATN4O95460 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN4O95460 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN4O95460 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN4O95460 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN4O95460 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MATN4O95460 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MATN4O95460 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MATN4O95460 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MATN4O95460 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MATN4O95460 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MATN4O95460 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MATN4O95460 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MATN4O95460 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MATN4O95460 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MATN4O95460 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MATN4O95460 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MATN4O95460 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MATN4O95460 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MATN4O95460 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MATN4O95460 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MATN4O95460 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MATN4O95460 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MATN4O95460 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN4O95460 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN4O95460 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN4O95460 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms