Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SBF1O95248 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SBF1O95248 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SBF1O95248 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SBF1O95248 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SBF1O95248 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBF1O95248 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBF1O95248 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBF1O95248 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SBF1O95248 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SBF1O95248 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SBF1O95248 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SBF1O95248 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SBF1O95248 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SBF1O95248 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SBF1O95248 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SBF1O95248 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SBF1O95248 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SBF1O95248 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SBF1O95248 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SBF1O95248 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SBF1O95248 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBF1O95248 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBF1O95248 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBF1O95248 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBF1O95248 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SBF1O95248 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SBF1O95248 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SBF1O95248 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SBF1O95248 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBF1O95248 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SBF1O95248 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SBF1O95248 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBF1O95248 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBF1O95248 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SBF1O95248 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SBF1O95248 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SBF1O95248 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SBF1O95248 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SBF1O95248 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SBF1O95248 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SBF1O95248 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SBF1O95248 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SBF1O95248 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SBF1O95248 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBF1O95248 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBF1O95248 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SBF1O95248 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SBF1O95248 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBF1O95248 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SBF1O95248 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SBF1O95248 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SBF1O95248 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SBF1O95248 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBF1O95248 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBF1O95248 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBF1O95248 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SBF1O95248 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SBF1O95248 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBF1O95248 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SBF1O95248 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SBF1O95248 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SBF1O95248 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBF1O95248 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBF1O95248 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SBF1O95248 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SBF1O95248 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBF1O95248 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBF1O95248 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SBF1O95248 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SBF1O95248 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBF1O95248 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBF1O95248 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBF1O95248 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SBF1O95248 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBF1O95248 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBF1O95248 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SBF1O95248 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SBF1O95248 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SBF1O95248 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SBF1O95248 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SBF1O95248 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SBF1O95248 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SBF1O95248 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SBF1O95248 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SBF1O95248 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBF1O95248 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBF1O95248 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBF1O95248 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SBF1O95248 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBF1O95248 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBF1O95248 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SBF1O95248 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SBF1O95248 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SBF1O95248 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SBF1O95248 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SBF1O95248 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SBF1O95248 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SBF1O95248 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SBF1O95248 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms