Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBL3O95164 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBL3O95164 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBL3O95164 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBL3O95164 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL3O95164 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBL3O95164 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL3O95164 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBL3O95164 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL3O95164 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL3O95164 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBL3O95164 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL3O95164 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL3O95164 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBL3O95164 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBL3O95164 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL3O95164 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL3O95164 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBL3O95164 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBL3O95164 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL3O95164 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL3O95164 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBL3O95164 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL3O95164 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBL3O95164 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBL3O95164 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBL3O95164 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL3O95164 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL3O95164 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL3O95164 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBL3O95164 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBL3O95164 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBL3O95164 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBL3O95164 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBL3O95164 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL3O95164 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL3O95164 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBL3O95164 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL3O95164 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL3O95164 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL3O95164 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBL3O95164 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBL3O95164 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBL3O95164 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBL3O95164 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBL3O95164 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBL3O95164 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBL3O95164 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBL3O95164 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBL3O95164 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBL3O95164 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBL3O95164 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL3O95164 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL3O95164 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL3O95164 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBL3O95164 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBL3O95164 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBL3O95164 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBL3O95164 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBL3O95164 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBL3O95164 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBL3O95164 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBL3O95164 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBL3O95164 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
UBL3O95164 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBL3O95164 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBL3O95164 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBL3O95164 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL3O95164 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL3O95164 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL3O95164 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL3O95164 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBL3O95164 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBL3O95164 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBL3O95164 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBL3O95164 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBL3O95164 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBL3O95164 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBL3O95164 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBL3O95164 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBL3O95164 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBL3O95164 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBL3O95164 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBL3O95164 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBL3O95164 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBL3O95164 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBL3O95164 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBL3O95164 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBL3O95164 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBL3O95164 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBL3O95164 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBL3O95164 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBL3O95164 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL3O95164 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL3O95164 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBL3O95164 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL3O95164 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL3O95164 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL3O95164 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBL3O95164 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms