Protein–RNA interactions for Protein: O95150

TNFSF15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF15O95150 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF15O95150 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF15O95150 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF15O95150 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF15O95150 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF15O95150 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF15O95150 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF15O95150 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF15O95150 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFSF15O95150 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFSF15O95150 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFSF15O95150 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF15O95150 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF15O95150 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms