Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATBO75879 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATBO75879 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATBO75879 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATBO75879 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATBO75879 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATBO75879 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATBO75879 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATBO75879 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATBO75879 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATBO75879 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATBO75879 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATBO75879 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATBO75879 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATBO75879 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATBO75879 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATBO75879 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATBO75879 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATBO75879 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATBO75879 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATBO75879 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATBO75879 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATBO75879 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATBO75879 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATBO75879 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATBO75879 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATBO75879 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATBO75879 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATBO75879 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATBO75879 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATBO75879 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATBO75879 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GATBO75879 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATBO75879 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATBO75879 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GATBO75879 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GATBO75879 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATBO75879 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATBO75879 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GATBO75879 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATBO75879 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATBO75879 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATBO75879 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATBO75879 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATBO75879 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATBO75879 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATBO75879 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATBO75879 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATBO75879 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATBO75879 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATBO75879 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATBO75879 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATBO75879 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATBO75879 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GATBO75879 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATBO75879 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATBO75879 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATBO75879 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATBO75879 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATBO75879 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GATBO75879 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATBO75879 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATBO75879 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATBO75879 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATBO75879 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATBO75879 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATBO75879 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATBO75879 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATBO75879 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GATBO75879 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATBO75879 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATBO75879 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATBO75879 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATBO75879 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATBO75879 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATBO75879 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATBO75879 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATBO75879 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATBO75879 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATBO75879 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATBO75879 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATBO75879 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATBO75879 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATBO75879 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATBO75879 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATBO75879 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GATBO75879 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATBO75879 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATBO75879 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATBO75879 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATBO75879 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATBO75879 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATBO75879 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATBO75879 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATBO75879 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GATBO75879 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATBO75879 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATBO75879 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GATBO75879 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATBO75879 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms