Protein–RNA interactions for Protein: O75764

TCEA3, Transcription elongation factor A protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA3O75764 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCEA3O75764 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCEA3O75764 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCEA3O75764 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCEA3O75764 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TCEA3O75764 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TCEA3O75764 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCEA3O75764 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCEA3O75764 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCEA3O75764 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TCEA3O75764 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCEA3O75764 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCEA3O75764 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCEA3O75764 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCEA3O75764 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TCEA3O75764 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCEA3O75764 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCEA3O75764 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms