Protein–RNA interactions for Protein: O75326

SEMA7A, Semaphorin-7A, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA7AO75326 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA7AO75326 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA7AO75326 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA7AO75326 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA7AO75326 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA7AO75326 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA7AO75326 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA7AO75326 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA7AO75326 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA7AO75326 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA7AO75326 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA7AO75326 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA7AO75326 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA7AO75326 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms