Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
DEPDC5O75140 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
DEPDC5O75140 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
DEPDC5O75140 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
DEPDC5O75140 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
DEPDC5O75140 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
DEPDC5O75140 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
DEPDC5O75140 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
DEPDC5O75140 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
DEPDC5O75140 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.42■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
DEPDC5O75140 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
DEPDC5O75140 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
DEPDC5O75140 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
DEPDC5O75140 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
DEPDC5O75140 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
DEPDC5O75140 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
DEPDC5O75140 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
DEPDC5O75140 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
DEPDC5O75140 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
DEPDC5O75140 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
DEPDC5O75140 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
DEPDC5O75140 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.16■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
DEPDC5O75140 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
DEPDC5O75140 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
DEPDC5O75140 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
DEPDC5O75140 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
DEPDC5O75140 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
DEPDC5O75140 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.05■■■■■ 4
DEPDC5O75140 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
DEPDC5O75140 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms