Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MSCO60682 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MSCO60682 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MSCO60682 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MSCO60682 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MSCO60682 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MSCO60682 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MSCO60682 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MSCO60682 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
MSCO60682 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MSCO60682 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MSCO60682 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MSCO60682 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
MSCO60682 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MSCO60682 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MSCO60682 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MSCO60682 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MSCO60682 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MSCO60682 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MSCO60682 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MSCO60682 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MSCO60682 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MSCO60682 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MSCO60682 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MSCO60682 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MSCO60682 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MSCO60682 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MSCO60682 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MSCO60682 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MSCO60682 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MSCO60682 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MSCO60682 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MSCO60682 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MSCO60682 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MSCO60682 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MSCO60682 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MSCO60682 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MSCO60682 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MSCO60682 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
MSCO60682 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MSCO60682 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MSCO60682 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MSCO60682 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MSCO60682 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MSCO60682 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MSCO60682 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MSCO60682 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MSCO60682 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MSCO60682 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MSCO60682 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MSCO60682 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MSCO60682 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MSCO60682 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
MSCO60682 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MSCO60682 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MSCO60682 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MSCO60682 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MSCO60682 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MSCO60682 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MSCO60682 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MSCO60682 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MSCO60682 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MSCO60682 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MSCO60682 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
MSCO60682 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MSCO60682 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MSCO60682 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MSCO60682 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MSCO60682 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MSCO60682 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
MSCO60682 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MSCO60682 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MSCO60682 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MSCO60682 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MSCO60682 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MSCO60682 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MSCO60682 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MSCO60682 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MSCO60682 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MSCO60682 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MSCO60682 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MSCO60682 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MSCO60682 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MSCO60682 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MSCO60682 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MSCO60682 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
MSCO60682 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MSCO60682 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MSCO60682 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MSCO60682 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MSCO60682 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MSCO60682 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MSCO60682 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
MSCO60682 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MSCO60682 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MSCO60682 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MSCO60682 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MSCO60682 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MSCO60682 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MSCO60682 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms