Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX15O60248 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX15O60248 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX15O60248 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX15O60248 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX15O60248 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX15O60248 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX15O60248 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX15O60248 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX15O60248 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX15O60248 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX15O60248 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX15O60248 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX15O60248 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX15O60248 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX15O60248 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX15O60248 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX15O60248 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX15O60248 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX15O60248 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX15O60248 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX15O60248 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX15O60248 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX15O60248 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX15O60248 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX15O60248 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX15O60248 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX15O60248 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX15O60248 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX15O60248 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX15O60248 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOX15O60248 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOX15O60248 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX15O60248 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOX15O60248 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOX15O60248 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX15O60248 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX15O60248 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX15O60248 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX15O60248 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX15O60248 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOX15O60248 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX15O60248 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX15O60248 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOX15O60248 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX15O60248 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOX15O60248 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOX15O60248 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX15O60248 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX15O60248 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOX15O60248 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX15O60248 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOX15O60248 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX15O60248 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOX15O60248 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOX15O60248 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX15O60248 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOX15O60248 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX15O60248 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX15O60248 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX15O60248 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOX15O60248 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX15O60248 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX15O60248 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX15O60248 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SOX15O60248 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOX15O60248 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX15O60248 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOX15O60248 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX15O60248 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOX15O60248 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX15O60248 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX15O60248 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOX15O60248 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX15O60248 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOX15O60248 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX15O60248 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOX15O60248 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX15O60248 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX15O60248 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX15O60248 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOX15O60248 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOX15O60248 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX15O60248 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX15O60248 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX15O60248 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOX15O60248 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX15O60248 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX15O60248 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SOX15O60248 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX15O60248 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX15O60248 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX15O60248 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms