Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX1O43933 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX1O43933 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX1O43933 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX1O43933 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX1O43933 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX1O43933 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX1O43933 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX1O43933 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX1O43933 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX1O43933 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX1O43933 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX1O43933 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PEX1O43933 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX1O43933 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX1O43933 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX1O43933 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX1O43933 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX1O43933 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX1O43933 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX1O43933 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX1O43933 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX1O43933 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX1O43933 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX1O43933 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX1O43933 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX1O43933 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX1O43933 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX1O43933 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX1O43933 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX1O43933 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX1O43933 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX1O43933 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX1O43933 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX1O43933 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX1O43933 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX1O43933 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX1O43933 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX1O43933 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX1O43933 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX1O43933 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX1O43933 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX1O43933 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PEX1O43933 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX1O43933 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX1O43933 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX1O43933 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX1O43933 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX1O43933 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX1O43933 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX1O43933 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX1O43933 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX1O43933 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX1O43933 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX1O43933 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX1O43933 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX1O43933 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX1O43933 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX1O43933 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX1O43933 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX1O43933 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEX1O43933 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX1O43933 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEX1O43933 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PEX1O43933 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX1O43933 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX1O43933 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEX1O43933 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PEX1O43933 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX1O43933 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEX1O43933 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PEX1O43933 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX1O43933 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEX1O43933 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX1O43933 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX1O43933 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX1O43933 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEX1O43933 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX1O43933 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEX1O43933 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEX1O43933 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX1O43933 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX1O43933 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX1O43933 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX1O43933 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEX1O43933 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX1O43933 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PEX1O43933 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX1O43933 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PEX1O43933 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX1O43933 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX1O43933 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX1O43933 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX1O43933 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX1O43933 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX1O43933 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX1O43933 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX1O43933 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX1O43933 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX1O43933 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms