Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA4O43374 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA4O43374 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASA4O43374 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA4O43374 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA4O43374 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASA4O43374 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASA4O43374 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASA4O43374 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASA4O43374 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASA4O43374 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASA4O43374 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RASA4O43374 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA4O43374 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASA4O43374 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASA4O43374 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASA4O43374 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA4O43374 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA4O43374 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA4O43374 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA4O43374 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RASA4O43374 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA4O43374 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA4O43374 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASA4O43374 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RASA4O43374 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA4O43374 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASA4O43374 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASA4O43374 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RASA4O43374 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA4O43374 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RASA4O43374 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASA4O43374 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RASA4O43374 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RASA4O43374 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RASA4O43374 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASA4O43374 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA4O43374 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA4O43374 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA4O43374 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASA4O43374 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA4O43374 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASA4O43374 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASA4O43374 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA4O43374 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA4O43374 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASA4O43374 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASA4O43374 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA4O43374 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA4O43374 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA4O43374 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA4O43374 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASA4O43374 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA4O43374 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASA4O43374 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RASA4O43374 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RASA4O43374 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RASA4O43374 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASA4O43374 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASA4O43374 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASA4O43374 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASA4O43374 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASA4O43374 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASA4O43374 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASA4O43374 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RASA4O43374 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASA4O43374 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RASA4O43374 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RASA4O43374 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASA4O43374 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASA4O43374 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RASA4O43374 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RASA4O43374 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RASA4O43374 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASA4O43374 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASA4O43374 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASA4O43374 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASA4O43374 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASA4O43374 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASA4O43374 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASA4O43374 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASA4O43374 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASA4O43374 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASA4O43374 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RASA4O43374 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASA4O43374 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASA4O43374 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RASA4O43374 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASA4O43374 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASA4O43374 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASA4O43374 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASA4O43374 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASA4O43374 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RASA4O43374 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RASA4O43374 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASA4O43374 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASA4O43374 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RASA4O43374 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RASA4O43374 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RASA4O43374 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms