Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LINC01565O15544 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LINC01565O15544 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LINC01565O15544 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LINC01565O15544 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC01565O15544 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC01565O15544 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC01565O15544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LINC01565O15544 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LINC01565O15544 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LINC01565O15544 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms