Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FABP7O15540 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FABP7O15540 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FABP7O15540 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FABP7O15540 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FABP7O15540 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FABP7O15540 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FABP7O15540 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FABP7O15540 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FABP7O15540 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FABP7O15540 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FABP7O15540 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FABP7O15540 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FABP7O15540 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FABP7O15540 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FABP7O15540 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FABP7O15540 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FABP7O15540 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FABP7O15540 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FABP7O15540 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FABP7O15540 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FABP7O15540 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FABP7O15540 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FABP7O15540 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FABP7O15540 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FABP7O15540 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FABP7O15540 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FABP7O15540 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FABP7O15540 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FABP7O15540 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FABP7O15540 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FABP7O15540 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FABP7O15540 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FABP7O15540 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FABP7O15540 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FABP7O15540 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FABP7O15540 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FABP7O15540 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FABP7O15540 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FABP7O15540 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FABP7O15540 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FABP7O15540 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FABP7O15540 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FABP7O15540 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FABP7O15540 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FABP7O15540 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FABP7O15540 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FABP7O15540 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FABP7O15540 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FABP7O15540 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FABP7O15540 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FABP7O15540 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FABP7O15540 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FABP7O15540 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FABP7O15540 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FABP7O15540 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FABP7O15540 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FABP7O15540 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FABP7O15540 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FABP7O15540 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FABP7O15540 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FABP7O15540 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FABP7O15540 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FABP7O15540 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FABP7O15540 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FABP7O15540 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FABP7O15540 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FABP7O15540 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FABP7O15540 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FABP7O15540 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FABP7O15540 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FABP7O15540 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FABP7O15540 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FABP7O15540 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FABP7O15540 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FABP7O15540 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FABP7O15540 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FABP7O15540 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FABP7O15540 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FABP7O15540 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FABP7O15540 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FABP7O15540 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FABP7O15540 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FABP7O15540 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FABP7O15540 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FABP7O15540 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FABP7O15540 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FABP7O15540 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FABP7O15540 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FABP7O15540 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FABP7O15540 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FABP7O15540 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FABP7O15540 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FABP7O15540 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FABP7O15540 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FABP7O15540 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FABP7O15540 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FABP7O15540 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FABP7O15540 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FABP7O15540 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms