Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
KIF3BO15066 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
KIF3BO15066 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
KIF3BO15066 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
KIF3BO15066 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
KIF3BO15066 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
KIF3BO15066 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
KIF3BO15066 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
KIF3BO15066 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
KIF3BO15066 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
KIF3BO15066 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
KIF3BO15066 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
KIF3BO15066 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
KIF3BO15066 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
KIF3BO15066 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.92■■■■■ 4.14
KIF3BO15066 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
KIF3BO15066 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
KIF3BO15066 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
KIF3BO15066 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KIF3BO15066 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.67■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
KIF3BO15066 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
KIF3BO15066 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
KIF3BO15066 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
KIF3BO15066 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KIF3BO15066 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
KIF3BO15066 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KIF3BO15066 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
KIF3BO15066 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
KIF3BO15066 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KIF3BO15066 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KIF3BO15066 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
KIF3BO15066 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.32■■■■■ 4.05
KIF3BO15066 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
KIF3BO15066 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms