Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SYNMO15061 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNMO15061 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SYNMO15061 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SYNMO15061 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNMO15061 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SYNMO15061 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNMO15061 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNMO15061 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNMO15061 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNMO15061 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SYNMO15061 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNMO15061 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNMO15061 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SYNMO15061 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SYNMO15061 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SYNMO15061 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SYNMO15061 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SYNMO15061 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SYNMO15061 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
SYNMO15061 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SYNMO15061 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
SYNMO15061 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
SYNMO15061 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SYNMO15061 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SYNMO15061 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SYNMO15061 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.01■■■■□ 3.99
SYNMO15061 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
SYNMO15061 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SYNMO15061 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
SYNMO15061 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SYNMO15061 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SYNMO15061 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SYNMO15061 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SYNMO15061 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SYNMO15061 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SYNMO15061 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYNMO15061 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYNMO15061 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYNMO15061 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYNMO15061 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SYNMO15061 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SYNMO15061 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SYNMO15061 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SYNMO15061 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SYNMO15061 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SYNMO15061 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SYNMO15061 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SYNMO15061 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SYNMO15061 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SYNMO15061 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SYNMO15061 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SYNMO15061 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SYNMO15061 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
SYNMO15061 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SYNMO15061 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
SYNMO15061 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
SYNMO15061 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SYNMO15061 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SYNMO15061 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SYNMO15061 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SYNMO15061 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNMO15061 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNMO15061 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
SYNMO15061 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNMO15061 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNMO15061 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SYNMO15061 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SYNMO15061 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
SYNMO15061 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SYNMO15061 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SYNMO15061 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
SYNMO15061 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
SYNMO15061 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
SYNMO15061 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYNMO15061 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYNMO15061 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SYNMO15061 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYNMO15061 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYNMO15061 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SYNMO15061 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SYNMO15061 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
SYNMO15061 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SYNMO15061 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SYNMO15061 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SYNMO15061 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNMO15061 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNMO15061 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SYNMO15061 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
SYNMO15061 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNMO15061 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNMO15061 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SYNMO15061 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SYNMO15061 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNMO15061 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNMO15061 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNMO15061 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
SYNMO15061 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNMO15061 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNMO15061 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms