Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
KDM6BO15054 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
KDM6BO15054 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
KDM6BO15054 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
KDM6BO15054 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
KDM6BO15054 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
KDM6BO15054 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
KDM6BO15054 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
KDM6BO15054 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
KDM6BO15054 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
KDM6BO15054 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.04■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
KDM6BO15054 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
KDM6BO15054 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
KDM6BO15054 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
KDM6BO15054 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
KDM6BO15054 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
KDM6BO15054 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
KDM6BO15054 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
KDM6BO15054 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
KDM6BO15054 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
KDM6BO15054 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
KDM6BO15054 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
KDM6BO15054 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
KDM6BO15054 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
KDM6BO15054 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
KDM6BO15054 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
KDM6BO15054 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
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