Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLD2O14939 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD2O14939 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLD2O14939 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD2O14939 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD2O14939 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLD2O14939 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLD2O14939 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLD2O14939 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLD2O14939 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLD2O14939 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLD2O14939 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLD2O14939 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLD2O14939 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD2O14939 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLD2O14939 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLD2O14939 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLD2O14939 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLD2O14939 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLD2O14939 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLD2O14939 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLD2O14939 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLD2O14939 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PLD2O14939 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD2O14939 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD2O14939 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLD2O14939 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD2O14939 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLD2O14939 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLD2O14939 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD2O14939 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD2O14939 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD2O14939 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD2O14939 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLD2O14939 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLD2O14939 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLD2O14939 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLD2O14939 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLD2O14939 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PLD2O14939 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLD2O14939 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLD2O14939 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLD2O14939 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLD2O14939 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLD2O14939 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLD2O14939 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PLD2O14939 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLD2O14939 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLD2O14939 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLD2O14939 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLD2O14939 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLD2O14939 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLD2O14939 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PLD2O14939 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLD2O14939 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLD2O14939 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLD2O14939 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLD2O14939 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLD2O14939 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLD2O14939 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PLD2O14939 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLD2O14939 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLD2O14939 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLD2O14939 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLD2O14939 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLD2O14939 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLD2O14939 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLD2O14939 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLD2O14939 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLD2O14939 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLD2O14939 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLD2O14939 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLD2O14939 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLD2O14939 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLD2O14939 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLD2O14939 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLD2O14939 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLD2O14939 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLD2O14939 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLD2O14939 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLD2O14939 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLD2O14939 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLD2O14939 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLD2O14939 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLD2O14939 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLD2O14939 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLD2O14939 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLD2O14939 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLD2O14939 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLD2O14939 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLD2O14939 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLD2O14939 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLD2O14939 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLD2O14939 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms