Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN4O14817 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN4O14817 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4O14817 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4O14817 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4O14817 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4O14817 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4O14817 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN4O14817 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSPAN4O14817 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN4O14817 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4O14817 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4O14817 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN4O14817 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4O14817 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN4O14817 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN4O14817 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms