Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDCD5O14737 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCD5O14737 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD5O14737 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCD5O14737 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD5O14737 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD5O14737 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD5O14737 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD5O14737 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD5O14737 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD5O14737 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD5O14737 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD5O14737 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD5O14737 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms