Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RGPD8O14715 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RGPD8O14715 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
RGPD8O14715 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RGPD8O14715 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RGPD8O14715 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RGPD8O14715 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
RGPD8O14715 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
RGPD8O14715 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RGPD8O14715 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RGPD8O14715 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RGPD8O14715 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RGPD8O14715 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RGPD8O14715 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RGPD8O14715 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RGPD8O14715 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RGPD8O14715 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RGPD8O14715 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RGPD8O14715 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RGPD8O14715 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RGPD8O14715 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RGPD8O14715 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
RGPD8O14715 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RGPD8O14715 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RGPD8O14715 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RGPD8O14715 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RGPD8O14715 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RGPD8O14715 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
RGPD8O14715 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms