Protein–RNA interactions for Protein: M0QZD8

LOC400499, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC400499M0QZD8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LOC400499M0QZD8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LOC400499M0QZD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LOC400499M0QZD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LOC400499M0QZD8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LOC400499M0QZD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LOC400499M0QZD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LOC400499M0QZD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOC400499M0QZD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LOC400499M0QZD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LOC400499M0QZD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LOC400499M0QZD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LOC400499M0QZD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LOC400499M0QZD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms