Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QR06 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QR06 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QR06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QR06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QR06 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QR06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QR06 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QR06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QR06 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QR06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QR06 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QR06 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QR06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QR06 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QR06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QR06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QR06 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QR06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QR06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QR06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QR06 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QR06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QR06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QR06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QR06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QR06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QR06 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QR06 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QR06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QR06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QR06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QR06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QR06 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QR06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QR06 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QR06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QR06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QR06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QR06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QR06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QR06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QR06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QR06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QR06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QR06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QR06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QR06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QR06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QR06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QR06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QR06 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QR06 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QR06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QR06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QR06 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QR06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QR06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QR06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QR06 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QR06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QR06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QR06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QR06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QR06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QR06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QR06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QR06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QR06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QR06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QR06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QR06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
J3QR06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
J3QR06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QR06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QR06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QR06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
J3QR06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
J3QR06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QR06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
J3QR06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QR06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QR06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QR06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
J3QR06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QR06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
J3QR06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QR06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QR06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QR06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QR06 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QR06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
J3QR06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms