Protein–RNA interactions for Protein: A8MUI8

Putative UPF0607 protein ENSP00000383783, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUI8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A8MUI8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A8MUI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A8MUI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A8MUI8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A8MUI8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A8MUI8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A8MUI8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A8MUI8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A8MUI8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A8MUI8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A8MUI8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A8MUI8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A8MUI8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
A8MUI8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A8MUI8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A8MUI8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A8MUI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A8MUI8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A8MUI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A8MUI8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A8MUI8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A8MUI8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A8MUI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
A8MUI8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A8MUI8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A8MUI8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A8MUI8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A8MUI8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A8MUI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A8MUI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A8MUI8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A8MUI8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A8MUI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A8MUI8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A8MUI8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A8MUI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A8MUI8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A8MUI8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
A8MUI8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A8MUI8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
A8MUI8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
A8MUI8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A8MUI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A8MUI8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A8MUI8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A8MUI8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A8MUI8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A8MUI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A8MUI8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A8MUI8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A8MUI8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A8MUI8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A8MUI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A8MUI8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A8MUI8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A8MUI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A8MUI8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A8MUI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A8MUI8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A8MUI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A8MUI8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A8MUI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A8MUI8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A8MUI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A8MUI8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A8MUI8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A8MUI8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A8MUI8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A8MUI8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
A8MUI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A8MUI8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A8MUI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A8MUI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A8MUI8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A8MUI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A8MUI8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A8MUI8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A8MUI8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A8MUI8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A8MUI8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A8MUI8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A8MUI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A8MUI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A8MUI8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A8MUI8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A8MUI8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
A8MUI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
A8MUI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A8MUI8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A8MUI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A8MUI8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A8MUI8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A8MUI8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms