Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WASHC1A8K0Z3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WASHC1A8K0Z3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WASHC1A8K0Z3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WASHC1A8K0Z3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WASHC1A8K0Z3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
WASHC1A8K0Z3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WASHC1A8K0Z3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WASHC1A8K0Z3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WASHC1A8K0Z3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WASHC1A8K0Z3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WASHC1A8K0Z3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WASHC1A8K0Z3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WASHC1A8K0Z3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1094.3 ms