Protein–RNA interactions for Protein: A6NNC1

Putative POM121-like protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNC1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NNC1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NNC1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NNC1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NNC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NNC1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NNC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NNC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NNC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNC1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NNC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNC1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NNC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNC1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNC1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NNC1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NNC1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A6NNC1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNC1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A6NNC1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A6NNC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A6NNC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNC1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A6NNC1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNC1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A6NNC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNC1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A6NNC1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A6NNC1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A6NNC1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A6NNC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A6NNC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNC1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNC1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNC1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNC1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNC1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNC1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNC1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNC1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNC1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A6NNC1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNC1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A6NNC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A6NNC1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNC1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A6NNC1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A6NNC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A6NNC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A6NNC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A6NNC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A6NNC1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A6NNC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNC1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNC1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNC1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A6NNC1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A6NNC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNC1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NNC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNC1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NNC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NNC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NNC1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NNC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NNC1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNC1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NNC1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms