Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP69A5D8W1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP69A5D8W1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP69A5D8W1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP69A5D8W1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP69A5D8W1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP69A5D8W1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP69A5D8W1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP69A5D8W1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP69A5D8W1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP69A5D8W1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP69A5D8W1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms