Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LCHNA4D1U4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LCHNA4D1U4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LCHNA4D1U4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LCHNA4D1U4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LCHNA4D1U4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LCHNA4D1U4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCHNA4D1U4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LCHNA4D1U4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LCHNA4D1U4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LCHNA4D1U4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LCHNA4D1U4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LCHNA4D1U4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCHNA4D1U4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCHNA4D1U4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LCHNA4D1U4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LCHNA4D1U4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LCHNA4D1U4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LCHNA4D1U4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LCHNA4D1U4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LCHNA4D1U4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCHNA4D1U4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCHNA4D1U4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LCHNA4D1U4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LCHNA4D1U4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LCHNA4D1U4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LCHNA4D1U4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LCHNA4D1U4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms