Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM72A0PK05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM72A0PK05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM72A0PK05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM72A0PK05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM72A0PK05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM72A0PK05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM72A0PK05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM72A0PK05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM72A0PK05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM72A0PK05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM72A0PK05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms