Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRBV2A0A0J9YWF9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV2A0A0J9YWF9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV2A0A0J9YWF9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRBV2A0A0J9YWF9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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